Умный и добрый Кубо живет спокойной жизнью, рассказывая истории о своих односельчанах. Но его тихая и размеренная жизнь внезапно заканчивается, когда он вызывает древнего духа, который хочет устроить вендетту из-за событий, случившихся пару веков назад. Кубо придется самому как-то убирать духа обратно, да попутно спасать деревню.